مدیریت پروژه (Project Management) برای برنامه ریزی پروژه، پیشبرد فرآیند ها، تعیین مسولیت های هر بخش از پروژه، برنامه ریزی کلیه اجزای پروژه ها و تعیین مسئولیت توسط مدیر پروژه بکار می رود. این زیرسیستم قابلیت مدیریت بخش های مختلف پروژه را نشان می دهد. کاربرد این زیرسیستم برای سازمان ها گامی هوشمندانه است که منجر به کاهش اشتباهات و مشکلات مربوط به پروژه های سازمان و هزینه ها می شود. این سیستم از دو بازوی قدرتمند برنامه‌ریزی و کنترل پروژه بهره می‌گیرد و لذا به ابزاری کاربردی و قدرتمند برای کنترل زمان، هزینه و مدیریت منابع و نیروی انسانی تبدیل گردیده است. کنترل پروژه در این راه از سه عامل زیر بهره می گیرد. هدف اصلی منطق، ایجاد بستری مطمئن و مناسب برای مدیریت پروژه با استفاده از مدیریت برنامه ها، کنترل منابع و ... بوده است. سیستم به نوعی طراحی شده که کاربران حتی با کمترین دانش قادر خواهند بود به سادگی پروژه ها، وظایف، منابع و ... را برنامه ریزی و بر روند انجام کار پروژه، مسلط بوده و گزارش ها و مستندات خود را مدیریت نمایند. ازجمله امکانات و قابلیت های زیرسیستم مدیریت پروژه منطق شامل امکان تعریف پروژه با فازهاي مختلف و تخصیص منابع به تعداد دلخواه براي هر کدام، انتخاب پروژه ها در تمام عملیات مالی ثبت شده در نرم افزار منطق، ذخیره فایل های مربوط به هر پروژه، امکان گزارش گیری از تمام موارد مالی ثبت شده مربوط به یک پروژه خاص، تعریف پروژه ها به تعداد نامحدود و تخصیص کد تفصیلی به هر کدام، امکان اطلاع از وضعیت پروژه ها برای برنامه ریزی بهتر و روند کار پروژه، امکان رسم نمودار هزینه های یک پروژه خاص، امکان ثبت و مشاهده تمامی مراحل پروژه اعم از فاز ها، منابع و تخصیص هزینه های آن پروژه، امکان مشاهده کمبود ها و موانع رشد پروژه درکوتاه ترین زمان، امکان تعیین زمان تقریبی برای هر فاز پروژه و... می باشد.